More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1525 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  48.15 
 
 		 759 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.43 
 
 		 752 aa  845    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  57.03 
 
 		 749 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  47.38 
 
 		 759 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  53.47 
 
 		 758 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  48.73 
 
 		 754 aa  697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  46.93 
 
 		 773 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  47.23 
 
 		 781 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  46.73 
 
 		 751 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  45.48 
 
 		 764 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  48.28 
 
 		 759 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  47.87 
 
 		 763 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  48.14 
 
 		 764 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  46.55 
 
 		 761 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  48.28 
 
 		 759 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  100 
 
 		 750 aa  1516    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1729  malic enzyme  47.49 
 
 		 763 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  47.52 
 
 		 752 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  45.71 
 
 		 756 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  46.9 
 
 		 779 aa  670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  57.94 
 
 		 752 aa  842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  45.62 
 
 		 779 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  55.96 
 
 		 749 aa  812    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  46.18 
 
 		 758 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  47.23 
 
 		 777 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  58.96 
 
 		 752 aa  850    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  47.4 
 
 		 763 aa  672    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  48.28 
 
 		 759 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  46.23 
 
 		 773 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  54.55 
 
 		 771 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  54.33 
 
 		 783 aa  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  57.24 
 
 		 749 aa  844    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  46.73 
 
 		 759 aa  653    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  47.73 
 
 		 761 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  46.88 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  46.89 
 
 		 759 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  46.65 
 
 		 769 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  57.16 
 
 		 752 aa  849    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  49.67 
 
 		 763 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  46.16 
 
 		 760 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  49.93 
 
 		 753 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  46.89 
 
 		 759 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  46.62 
 
 		 756 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  54.55 
 
 		 771 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  55.75 
 
 		 773 aa  790    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  49.06 
 
 		 754 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  45.17 
 
 		 769 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  47.11 
 
 		 758 aa  659    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  47.14 
 
 		 754 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  56.48 
 
 		 779 aa  830    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  50.27 
 
 		 766 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  46.69 
 
 		 771 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  47.2 
 
 		 764 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  46.66 
 
 		 767 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  46.93 
 
 		 773 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  46.03 
 
 		 760 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  48.13 
 
 		 763 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  47.91 
 
 		 753 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  47.35 
 
 		 759 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  46.89 
 
 		 759 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  46.02 
 
 		 777 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  47.73 
 
 		 773 aa  668    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  48.28 
 
 		 759 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  45.93 
 
 		 751 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  49 
 
 		 754 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  46.65 
 
 		 775 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  46.48 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  46.7 
 
 		 770 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  48.26 
 
 		 761 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  52.2 
 
 		 757 aa  762    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  47.08 
 
 		 755 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  47.65 
 
 		 765 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  44.93 
 
 		 776 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  54.41 
 
 		 771 aa  766    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  47.33 
 
 		 758 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  49.47 
 
 		 761 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  45.84 
 
 		 756 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  46.61 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  48.93 
 
 		 761 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  46.35 
 
 		 756 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  46.48 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  48.15 
 
 		 759 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  45.96 
 
 		 775 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  57.5 
 
 		 757 aa  812    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  46.23 
 
 		 756 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  47 
 
 		 760 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>