29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3007 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1187    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  51.84 
 
 
891 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  51.54 
 
 
773 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  47.91 
 
 
792 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  48.29 
 
 
769 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  45.17 
 
 
758 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  46.13 
 
 
709 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  45.39 
 
 
710 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  46.82 
 
 
618 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  39.56 
 
 
760 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  44.57 
 
 
717 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  44.69 
 
 
629 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  42.75 
 
 
289 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  43.12 
 
 
289 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  43.17 
 
 
620 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 
510 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0297  endo-alpha-mannosidase  26.85 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  22.58 
 
 
609 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1831  hypothetical protein  25.69 
 
 
711 aa  57  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
734 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
734 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  25.38 
 
 
510 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2683  hypothetical protein  21.13 
 
 
332 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.926327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1589  hypothetical protein  25.5 
 
 
667 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  22.6 
 
 
348 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 
383 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
1247 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4327  hypothetical protein  21.1 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.95 
 
 
368 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>