57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0039 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
152 aa  300  6e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0729  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 
191 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4387  hypothetical protein  42.25 
 
 
192 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  36.3 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  36.3 
 
 
212 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  38.57 
 
 
203 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0652  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 
186 aa  79  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297918  normal  0.0118286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1221  hypothetical protein  27.38 
 
 
218 aa  60.5  8e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1195  hypothetical protein  26.79 
 
 
218 aa  60.1  1e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1414  hypothetical protein  25.5 
 
 
183 aa  58.2  4e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1618  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 
147 aa  53.5  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  32.7 
 
 
199 aa  52  3e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 
151 aa  51.6  4e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  26.71 
 
 
204 aa  50.8  7e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 
157 aa  49.3  2e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  36.43 
 
 
222 aa  48.5  3e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.51 
 
 
211 aa  47.8  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  27.03 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.15162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0846  hypothetical protein  30.33 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.97425e-10  hitchhiker  2.18061e-06 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2895  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  22.07 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.62 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  25.71 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  25.71 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3021  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0161641  hitchhiker  8.46709e-06 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3004  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.055399  hitchhiker  4.287e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2969  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0101702  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3128  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  normal  0.0197186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  24.83 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2938  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.95475e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  28.71 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  26.88 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  24.49 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  22.93 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  29.59 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 
197 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  28.71 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  28.71 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0146  hypothetical protein  43.1 
 
 
224 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  24.73 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  23.53 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  23.53 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  23.84 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0551  hypothetical protein  21.92 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1771  membrane-associated protein  34.29 
 
 
184 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.315359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>