18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0332 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  435  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 
210 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  31.55 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1778  SNARE associated Golgi protein  37.78 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.847785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 
152 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1158  hypothetical protein  36.57 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2895  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  30.22 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  29.5 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  30.94 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1221  hypothetical protein  24.32 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1195  hypothetical protein  23.65 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1414  hypothetical protein  23.65 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.06 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
267 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>