14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0506 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  29.19 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  28.87 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  27.04 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  27.04 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  26.21 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  26.21 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  23.08 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  26.92 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  28.73 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  27.87 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>