14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6337 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  66.13 
 
 
205 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  65.24 
 
 
205 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  55.61 
 
 
206 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  56.5 
 
 
207 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  54.31 
 
 
214 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  54.31 
 
 
214 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  56 
 
 
207 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  56 
 
 
207 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  55.5 
 
 
207 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  51.78 
 
 
213 aa  218  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  27.32 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  25.87 
 
 
207 aa  42  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>