14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0053 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  90.2 
 
 
207 aa  361  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  59.9 
 
 
214 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  59.9 
 
 
214 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  61.05 
 
 
206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  56.85 
 
 
213 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  54.3 
 
 
205 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  54.64 
 
 
205 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  55.5 
 
 
213 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  26.8 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0644  hypothetical protein  26.15 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3718  hypothetical protein  29.13 
 
 
150 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>