12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5611 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  62.94 
 
 
214 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  62.94 
 
 
214 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  61.35 
 
 
207 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  60.91 
 
 
213 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  60.78 
 
 
207 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  60.29 
 
 
207 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  60.29 
 
 
207 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  54.5 
 
 
205 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  56.61 
 
 
205 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  55.67 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  29.02 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>