12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0198 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  78.47 
 
 		 214 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  78.47 
 
 		 214 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  63.39 
 
 		 206 aa  247  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  56.28 
 
 		 207 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  56.28 
 
 		 207 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  56.85 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  55.84 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  46.03 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  52.49 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  46.41 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  23.08 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>