14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1553 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1310  hypothetical protein  89.71 
 
 
207 aa  358  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.021523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4371  putative transmembrane protein  59 
 
 
214 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4503  hypothetical protein  59 
 
 
214 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5611  hypothetical protein  60.53 
 
 
206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144392  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0198  hypothetical protein  56.28 
 
 
213 aa  237  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.299647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5861  hypothetical protein  54.84 
 
 
205 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0526884  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6232  hypothetical protein  55.19 
 
 
205 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6337  hypothetical protein  56 
 
 
213 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0310095  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0644  hypothetical protein  25.38 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3718  hypothetical protein  29.13 
 
 
150 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>