12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1318 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  61.27 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1778  SNARE associated Golgi protein  61.19 
 
 
205 aa  222  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.847785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1158  hypothetical protein  54.64 
 
 
204 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  31.67 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  32.37 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2895  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0644  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1553  hypothetical protein  24.4 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1466  hypothetical protein  24.4 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0053  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>