14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0347 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1778  SNARE associated Golgi protein  76.21 
 
 
205 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.847785 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  61.27 
 
 
207 aa  237  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1158  hypothetical protein  50.78 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  29.85 
 
 
210 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  32.18 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  25.35 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  27.18 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2895  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  26.04 
 
 
225 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0729  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 
191 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  24.03 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>