53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1058 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
210 aa  420  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  29.85 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  32.45 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  31.49 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1778  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.847785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1158  hypothetical protein  32.45 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0506  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  27.89 
 
 
201 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.21 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  27.21 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  26.53 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.53 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.53 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  27.66 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  26.53 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  26.53 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  27.86 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  27.86 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.14 
 
 
207 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.35 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  26.99 
 
 
187 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  21.25 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  26.63 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  26.63 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  24.81 
 
 
152 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  25.76 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  22.44 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  24.42 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  33.87 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  33.87 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  27.4 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  24.09 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2895  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  22.02 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  22.02 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  23.08 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  26.09 
 
 
200 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  26.71 
 
 
195 aa  42  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  21.97 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  21.97 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  23.64 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.48 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.26 
 
 
251 aa  41.6  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>