More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1535 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.55 
 
 		 271 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.55 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.55 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.55 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.55 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.55 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.45 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  57.45 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.45 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  57.45 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.45 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.45 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  57.09 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.09 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  57.09 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  55.04 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.32 
 
 		 271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  55.04 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.96 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.96 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.68 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  55.47 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.88 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.52 
 
 		 271 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.99 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  53.99 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  52.17 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.26 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  50.94 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  51.31 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  53.23 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  49.64 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  51.25 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  53.99 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  49.58 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  49.58 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  49.58 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  48.75 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  46.03 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  43.68 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  43.68 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  39.64 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.64 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  43.26 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  40.79 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  42.44 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  43.28 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  40.76 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  42.28 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  42.28 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  43.1 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  43.33 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  42.39 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  41.6 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  40.65 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  41.91 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.87 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.87 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  45.3 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  42.86 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.54 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.54 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.54 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  37.68 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.44 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.6 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.42 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  38.69 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  39.86 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  42.55 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  42.02 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.82 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  39.13 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  39.13 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  39.13 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.13 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  47.49 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  42.08 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  41.99 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.08 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  41.45 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.5 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.88 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.77 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.05 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.1 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  41.81 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>