118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1759 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  64.67 
 
 
245 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  59.56 
 
 
234 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  59.78 
 
 
245 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  59.78 
 
 
244 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  60.33 
 
 
261 aa  204  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  58.7 
 
 
287 aa  200  1e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  57.61 
 
 
288 aa  196  2e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  57.07 
 
 
279 aa  195  4e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  57.07 
 
 
280 aa  195  4e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  57.07 
 
 
280 aa  195  5e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  57.07 
 
 
280 aa  195  5e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  57.07 
 
 
280 aa  195  5e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.52 
 
 
278 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  57.07 
 
 
318 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  57.07 
 
 
327 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.52 
 
 
278 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  56.52 
 
 
263 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  56.52 
 
 
263 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  57.07 
 
 
288 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  56.83 
 
 
263 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.98 
 
 
285 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  55.98 
 
 
263 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  56.52 
 
 
238 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.37 
 
 
253 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  50 
 
 
245 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  47.28 
 
 
241 aa  164  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  45.7 
 
 
243 aa  163  2e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  48.35 
 
 
247 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  48.42 
 
 
243 aa  162  4e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.55 
 
 
245 aa  162  4e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.91 
 
 
244 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  46.2 
 
 
232 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  47.28 
 
 
243 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  47.28 
 
 
243 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  48.9 
 
 
247 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  46.49 
 
 
236 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  48.11 
 
 
258 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  42.39 
 
 
243 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  47.83 
 
 
243 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.32 
 
 
247 aa  134  1e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  46.77 
 
 
220 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  46.77 
 
 
220 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  46.77 
 
 
220 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.41 
 
 
247 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.41 
 
 
247 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  41.53 
 
 
239 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  44.57 
 
 
243 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  38.04 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.46 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  31.87 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  37.3 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  38.38 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  37.3 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  37.3 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.22 
 
 
242 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.76 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  39.13 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  35.87 
 
 
247 aa  84  1e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 
252 aa  80.5  2e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  40.41 
 
 
205 aa  76.6  2e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  40.22 
 
 
220 aa  76.3  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.04 
 
 
250 aa  76.3  3e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.33 
 
 
240 aa  75.9  4e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  36.22 
 
 
240 aa  75.1  7e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  36.22 
 
 
240 aa  75.1  7e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  33.7 
 
 
254 aa  74.7  8e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  35.68 
 
 
242 aa  74.7  9e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.91 
 
 
239 aa  72  5e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.55 
 
 
251 aa  70.5  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  32.07 
 
 
227 aa  69.3  3e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.04 
 
 
245 aa  68.9  5e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.04 
 
 
245 aa  68.9  5e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  27.47 
 
 
259 aa  68.6  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  32.64 
 
 
249 aa  68.2  8e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  30 
 
 
248 aa  67.4  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.98 
 
 
256 aa  67.8  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.55 
 
 
250 aa  67.4  1e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  34.97 
 
 
251 aa  67.4  2e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  29.41 
 
 
212 aa  66.2  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  32.97 
 
 
245 aa  65.9  4e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  37.5 
 
 
246 aa  65.5  5e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  34.24 
 
 
250 aa  65.1  6e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  32.42 
 
 
245 aa  65.1  8e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.59 
 
 
262 aa  64.3  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  29.95 
 
 
248 aa  63.9  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.57 
 
 
226 aa  60.8  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  26.57 
 
 
245 aa  58.9  4e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  58.9  5e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  28.75 
 
 
266 aa  58.5  6e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  26.71 
 
 
245 aa  58.5  7e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.48 
 
 
245 aa  58.2  8e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
627 aa  57.8  1e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.48 
 
 
250 aa  58.2  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.44 
 
 
249 aa  57.8  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.62 
 
 
247 aa  57.4  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  31.09 
 
 
213 aa  56.6  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.93 
 
 
241 aa  56.2  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  31.09 
 
 
213 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  29.89 
 
 
223 aa  55.1  8e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>