197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0834 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  100 
 
 		 155 aa  323  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  66.15 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  44.7 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  45.74 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  42.42 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  44.96 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  44.62 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  45.24 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  40.48 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  37.21 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  37.98 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  33.83 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  42.31 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  39.53 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  39.53 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  38.76 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  40.62 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  37.98 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  36.03 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  37.98 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  34.62 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  35.29 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  34.78 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.71 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  36.43 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  34.11 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  35.66 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  35.66 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.35 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.88 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.96 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 722 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  33.33 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  34.11 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  32.56 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  30.3 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  32.26 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 963 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.92 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 		 689 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 579 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 963 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  33.08 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  30.22 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  30.3 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  27.14 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  34.13 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 515 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  31.09 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 941 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 518 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  28.46 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  30.95 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  32.54 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  30 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 779 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  29.2 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  29.71 
 
 		 529 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  31.03 
 
 		 615 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 526 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  30.77 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  32.37 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 518 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 529 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  32.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  29.69 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  28.86 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  26.87 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  26.12 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  27.87 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  29.37 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>