More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3543 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 403 aa  806    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  56.14 
 
 		 576 aa  255  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  57.89 
 
 		 564 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  45.45 
 
 		 568 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  43.04 
 
 		 580 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  46.05 
 
 		 567 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  42.13 
 
 		 576 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  40.68 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  43.35 
 
 		 568 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  35.55 
 
 		 582 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  37.25 
 
 		 603 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  45.1 
 
 		 572 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  42.38 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  41.43 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  40.27 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  42.23 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  40.85 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  40.19 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  43.14 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  40.98 
 
 		 589 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  40.98 
 
 		 589 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 589 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 589 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 589 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 589 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 589 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  37.12 
 
 		 578 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  40.98 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  40.49 
 
 		 589 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  38.83 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  38.57 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  39.38 
 
 		 455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  41.46 
 
 		 589 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  40.18 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  42.36 
 
 		 591 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  43.69 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  41.58 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 645 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  37.95 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  39.22 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  40.67 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 579 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  40.67 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  42.03 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  40.67 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  41.15 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  39.51 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  41.18 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  39.81 
 
 		 1018 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  38.35 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  41.15 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  37.01 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  36.54 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  37.5 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  36.89 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  35.15 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  38.79 
 
 		 584 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  38.79 
 
 		 584 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  38.83 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 654 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  35.53 
 
 		 558 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  38.54 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  40.81 
 
 		 557 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  39.52 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  40.81 
 
 		 557 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  40.81 
 
 		 557 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 557 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  40.81 
 
 		 557 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  38.5 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  37.09 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  38.5 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 1016 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  39.91 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  39.91 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  39.91 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  39.19 
 
 		 557 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  39.19 
 
 		 557 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  39.91 
 
 		 565 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  36.28 
 
 		 610 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 558 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  37.13 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  33.49 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  45.71 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  38.81 
 
 		 516 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  39.71 
 
 		 587 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  36.52 
 
 		 563 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  38.29 
 
 		 566 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  38.57 
 
 		 565 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  38.12 
 
 		 556 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>