78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2969 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 172 aa  339  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.76 
 
 		 174 aa  225  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  62.13 
 
 		 175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.02 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  58.68 
 
 		 170 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.71 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.24 
 
 		 133 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  45 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.72 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.85 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  40.36 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.72 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.75 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  36.53 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.48 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.24 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.4 
 
 		 407 aa  72  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  34.76 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.33 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  38.33 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.71 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.13 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.02 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.97 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.61 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  24.86 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  31.19 
 
 		 385 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.97 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  28.22 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.14 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  27.87 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.34 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.7 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.02 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.32 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.73 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.06 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.52 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.84 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.39 
 
 		 352 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.71 
 
 		 368 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.07 
 
 		 187 aa  44.3  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.03 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.3 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.39 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.39 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.03 
 
 		 359 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  27.39 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  27.39 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.29 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  28.05 
 
 		 423 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  28.92 
 
 		 403 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.75 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  29.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  28.49 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.86 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  28.76 
 
 		 404 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.68 
 
 		 360 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.39 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  26.75 
 
 		 352 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  28.76 
 
 		 404 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  28.76 
 
 		 404 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  28.76 
 
 		 404 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  25.3 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  28.76 
 
 		 404 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  28.1 
 
 		 404 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.56 
 
 		 412 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>