71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4510 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 133 aa  258  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  65.89 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  65.12 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  65.12 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  59.7 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  64.18 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  62.79 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  62.77 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  62.79 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  59.23 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  59.69 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  57.36 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  57.25 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  55.47 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  55.81 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  55.04 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  58.59 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.46 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  62.79 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  60.47 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  55.04 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  57.48 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  51.54 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  54.62 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  52.85 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  45.24 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  36 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  47.14 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  46.15 
 
 		 452 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.94 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.54 
 
 		 363 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  47.62 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  45.16 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  41.43 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  39.44 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  43.55 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  39.68 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  39.68 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 140 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 		 270 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  42.42 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  39.39 
 
 		 366 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  39.68 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1056  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 364 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  33.85 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  36.67 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0998  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  37.61 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  33.85 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  37.68 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  38.1 
 
 		 374 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  35 
 
 		 90 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>