43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4413 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  51.31 
 
 
270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  51.31 
 
 
270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  50.94 
 
 
270 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  44.61 
 
 
277 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  45.17 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  39.07 
 
 
284 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  36.73 
 
 
260 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  31.44 
 
 
272 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  32.58 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  32.58 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  32.58 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  30.37 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  31.32 
 
 
268 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  27.97 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  30.38 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  28.85 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  26.56 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  26.56 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  27.6 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  24.48 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.47 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  27.87 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  26.8 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  27.48 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  25.48 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  24.82 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  26.82 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  25.93 
 
 
268 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  24.62 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  25.94 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  25.7 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  25.09 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  23.9 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  25.94 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  30.38 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  30.38 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  30.38 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  25.19 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  46 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  31.11 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>