56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4383 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  67.33 
 
 		 168 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  67.33 
 
 		 152 aa  204  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  67.33 
 
 		 152 aa  204  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  66.67 
 
 		 152 aa  203  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  66 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  68.46 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  55.41 
 
 		 163 aa  166  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  54.93 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  39.86 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  34.27 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  34.56 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  34.75 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.19 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  34.68 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.86 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.93 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  35.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  35.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  32.48 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.89 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  30.89 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  29.85 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  31.2 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  27.21 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  26.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.16 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.2 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  32.54 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.1 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.83 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  28.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.67 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  30.87 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  24.41 
 
 		 147 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  28.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>