92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3009 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  64.96 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  64.36 
 
 
266 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  64.36 
 
 
272 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  64.36 
 
 
272 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  62.55 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  64 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  66.41 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  53.02 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  49.01 
 
 
281 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  48.84 
 
 
240 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  44.35 
 
 
218 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  40.07 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  40.79 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  40 
 
 
254 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  38.14 
 
 
280 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  39.92 
 
 
285 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  39.06 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  40.41 
 
 
292 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  37.93 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  35.96 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  34.4 
 
 
302 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  35.52 
 
 
232 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  32.21 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  45.16 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  29.39 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  29.84 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  31.35 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  27.61 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  28.14 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  36.45 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  27.13 
 
 
204 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2269  DivIVA domain protein  72.5 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  26.44 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  25.61 
 
 
222 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  27.45 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  27.03 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  26.28 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  29.06 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1038  DivIVA family protein  25.65 
 
 
170 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  22.69 
 
 
206 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  48.33 
 
 
170 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2545  DivIVA family protein  46.67 
 
 
168 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  25.33 
 
 
161 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  53.19 
 
 
350 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  26.82 
 
 
245 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  57.89 
 
 
99 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  27.44 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  27.44 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  27.44 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0597  DivIVA family protein  25.15 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000335111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  43.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1264  DivIVA family protein  26.75 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.746002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2379  cell division protein GpsB  42.19 
 
 
98 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5835  DivIVA domain protein  23.93 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  25.15 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  28.29 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0056  hypothetical protein  47.5 
 
 
116 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0485848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0046  hypothetical protein  47.5 
 
 
116 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.884886  hitchhiker  0.00802794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  56.41 
 
 
631 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0065  hypothetical protein  47.5 
 
 
116 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425042  normal  0.0470908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  63.33 
 
 
89 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  25.77 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1819  cell division protein DivIVA, putative  28.28 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00249863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2105  putative cell division protein DivIVA  28.28 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0958  cell division initiation protein  25.35 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0429766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  26.57 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0923  cell division protein GpsB  28.21 
 
 
120 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.932524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  37.25 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  30.7 
 
 
442 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  28.66 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  28.29 
 
 
427 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  23.53 
 
 
153 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  47.5 
 
 
89 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0600  DivIVA family protein  41.51 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00107813  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  36.84 
 
 
452 aa  43.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2081  DivIVA family protein  29.82 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  hitchhiker  0.0000000000174011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  29.21 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1818  cell division initiation protein  36.76 
 
 
128 aa  42.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000693197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0788  hypothetical protein  22.37 
 
 
154 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000906817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1166  DivIVA family protein  27.11 
 
 
149 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>