41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  100 
 
 
237 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  37.95 
 
 
228 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  40 
 
 
232 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  40.89 
 
 
224 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  38.22 
 
 
205 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  40.42 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  39.01 
 
 
195 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  40 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  34.22 
 
 
204 aa  108  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  33.06 
 
 
247 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  35.1 
 
 
316 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  32.79 
 
 
285 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  34.17 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  30.96 
 
 
292 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  34.57 
 
 
350 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  29.82 
 
 
302 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  31.85 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  30.71 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  29.79 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  45.45 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  29.84 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  31.38 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  26.3 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  28.63 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  27.14 
 
 
281 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  29.83 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  28.57 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  28.16 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  30.93 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  26.64 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  30 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  31.36 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  28.06 
 
 
271 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  60.61 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  35.06 
 
 
442 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16490  DivIVA protein  29.46 
 
 
268 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.537974  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2081  DivIVA family protein  26.79 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  hitchhiker  0.0000000000174011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  38.89 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  25.66 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  36.36 
 
 
1736 aa  42.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>