27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16490  DivIVA protein  100 
 
 
268 aa  524  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.537974  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  33.71 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  55.77 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  55.77 
 
 
280 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  55.77 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  53.85 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  48.08 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  53.06 
 
 
347 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  48.08 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  48.08 
 
 
247 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  30.61 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  38.24 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  43.28 
 
 
316 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  41.79 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  44 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  25.27 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  40 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  42 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  27.92 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  40.43 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  43.4 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  43.4 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  36.36 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  36.47 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  43.4 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  43.4 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>