86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0494 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2081  DivIVA family protein  36.72 
 
 
268 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  hitchhiker  0.0000000000174011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09410  DivIVA protein  33.52 
 
 
262 aa  89  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0738055  normal  0.126085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  28.64 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  32.72 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  25.87 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  31.4 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  31.82 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1819  cell division protein DivIVA, putative  26.47 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00249863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  29.48 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2105  putative cell division protein DivIVA  26.47 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  25.89 
 
 
289 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  27.23 
 
 
291 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  27.13 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  27.83 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  28.96 
 
 
292 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  27.22 
 
 
168 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  29.09 
 
 
273 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5835  DivIVA domain protein  29.31 
 
 
298 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  25.39 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0616  cell division initiation protein, DivIVA-like  26.83 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362159  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1264  DivIVA family protein  27.07 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.746002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1038  DivIVA family protein  27.16 
 
 
170 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  26.8 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  31.32 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2890  DivIVA family protein  31.21 
 
 
344 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  27.04 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  30.43 
 
 
153 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1493  DivIVA family protein  27.38 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  25.93 
 
 
168 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  28.05 
 
 
271 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  25.93 
 
 
168 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  29.77 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  25.93 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2545  DivIVA family protein  25.93 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  25.31 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2723  DivIVA family protein  26.79 
 
 
148 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  30.41 
 
 
291 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1166  DivIVA family protein  28.4 
 
 
149 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  30.11 
 
 
281 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4951  hypothetical protein  32.03 
 
 
280 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  36.84 
 
 
316 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0862  hypothetical protein  28.79 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00599598  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  26.4 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  28.03 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  36.99 
 
 
350 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  25.79 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2453  DivIVA family protein  26.83 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12114  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08940  cell division initiation protein  26.8 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.954318  hitchhiker  0.0000000349233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  30.88 
 
 
307 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  28.66 
 
 
272 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  28.66 
 
 
272 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  28.66 
 
 
272 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1835  hypothetical protein  30.16 
 
 
181 aa  48.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.621323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1165  hypothetical protein  26.38 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000872304  hitchhiker  0.00617601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  25.66 
 
 
237 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0414  DivIVA family protein  27.44 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000218061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1197  cell division initiation protein  24.42 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0865  cell division protein DivIVA, putative  27.13 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2167  DivIVA family protein  29.87 
 
 
302 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  35 
 
 
274 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  26.67 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  29.03 
 
 
427 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2549  DivIVA family protein  24.55 
 
 
167 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2645  DivIVA family protein  24.55 
 
 
167 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  26.06 
 
 
247 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  24.08 
 
 
205 aa  45.1  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2262  DivIVA domain protein  24.54 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  25.35 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  25.59 
 
 
347 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3636  DivIVA family protein  25.95 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.212032  normal  0.492397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1311  hypothetical protein  24.55 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1488  cell division initiation protein  26.01 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2057  cell division initiation protein  24.43 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.46149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0484  cell division protein DivIVA, putative  26.22 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  28.23 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2210  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  34.78 
 
 
225 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0757  cell-division initiation protein, putative  23.64 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.04044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>