36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2228 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  100 
 
 
257 aa  507  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  36.27 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4951  hypothetical protein  31.71 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  32.18 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  28.87 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  30.6 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  28.45 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  28.05 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  27.54 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  28.03 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  26.44 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  30.3 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  31.95 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  26.78 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  29.63 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  27.52 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  26.78 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  26.78 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  26.53 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  29.15 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  30.21 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  34.29 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  30.32 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  28 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  26.29 
 
 
161 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  22.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  26.84 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  26.14 
 
 
152 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  34.38 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  25.6 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  25.37 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  29.23 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  29.73 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  27.97 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  46.88 
 
 
134 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  22.87 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>