141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0695 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  63.64 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  64.55 
 
 		 116 aa  156  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  60.53 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  63.37 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  63.37 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  65.35 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  63.64 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  54.95 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  63.44 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  56.07 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  50.89 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  51.82 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  55.24 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  59.57 
 
 		 121 aa  120  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  55.34 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  56.31 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  50.89 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  51.82 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  61.8 
 
 		 115 aa  118  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  55.88 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  52.38 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  61.96 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  51.89 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  57.61 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  54.08 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  45.61 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  48.51 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  50.96 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  49.56 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  32.99 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  38.78 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  37.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  37.08 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  31.63 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  31.96 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  31.63 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  31.63 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  32.38 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  36.26 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  31.63 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  30.93 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  34.83 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  34.07 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  34.83 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  34.41 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  31.82 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  34.15 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  32.99 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  28.72 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  34.09 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  34.09 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  27.66 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  32.58 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  32.11 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0314  protein of unknown function DUF485  31.87 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  31.03 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  31.87 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  31.87 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  31.87 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  32.11 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  32.11 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  32.93 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  28.18 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6217  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  34.09 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  31.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  27.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  31.11 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  31.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  33.7 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2886  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  30.21 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2261  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2930  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462047  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2875  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2792  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  30.77 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  29.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  29.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  29.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  29.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>