More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1066 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  100 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  96 
 
 		 175 aa  347  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  77.12 
 
 		 159 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  67.09 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  61.84 
 
 		 169 aa  194  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.67 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  58.67 
 
 		 166 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  61.07 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  58.67 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.33 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  51.7 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  51.35 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  53.1 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  46.79 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1362  hexapaptide repeat-containing transferase  50.66 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  41.29 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  43.62 
 
 		 202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  44.3 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.51 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  41.22 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  40.97 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  43.26 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  37.87 
 
 		 310 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  39.39 
 
 		 309 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.66 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  39.86 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  41.61 
 
 		 517 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  40.14 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.49 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  41.1 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 517 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  39.1 
 
 		 206 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  33.13 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  36.2 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.74 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  39.58 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  36.67 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  37.58 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.75 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  38.46 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  36.36 
 
 		 193 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  37.58 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  34.03 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  38 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  37.5 
 
 		 315 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  38.78 
 
 		 197 aa  98.2  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  36.81 
 
 		 317 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.81 
 
 		 316 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.31 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  34.39 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  35.58 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  38.51 
 
 		 207 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  38.1 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  35.53 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  34.23 
 
 		 312 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.6 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  35.53 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.55 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  36.55 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.67 
 
 		 313 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  36.05 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  36.55 
 
 		 212 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.62 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  37.41 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  32.89 
 
 		 228 aa  90.9  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  34.69 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  35.71 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.06 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 		 254 aa  89  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  37.13 
 
 		 246 aa  88.6  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.88 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  34.01 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.22 
 
 		 211 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  38 
 
 		 249 aa  85.1  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  36.17 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  38.35 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.39 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  36.54 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  34.46 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  36.48 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  32.65 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  30.87 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  33.11 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  39.68 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.97 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  32.1 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  34.44 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.11 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  37.21 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  38.3 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  39.83 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  35.04 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  35.04 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  36.8 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.41 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>