86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0115 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0096  hypothetical protein  94.59 
 
 		 259 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000827062 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  32.74 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  37.13 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  34.98 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  26.64 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  37.3 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  31.56 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  27.36 
 
 		 621 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  27.62 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  28.73 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  35.15 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  34.21 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  29.8 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  29.9 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  29.78 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  31.5 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  31.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  32.61 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  33.33 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  31.9 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  32.78 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  22.53 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  22.53 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  32.43 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  23.87 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  31.43 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  31.31 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  29.05 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  29.85 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  29.25 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  28.64 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  29.11 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  31.63 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  32.78 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  29.72 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  27.46 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  29.18 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  29.05 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  26.36 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  21.98 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  31.02 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  32.75 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  28.3 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  30.5 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  30.5 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  30.5 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  30.5 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.85 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  27.49 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  25.79 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  30.05 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  34.1 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  27.47 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  31.48 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  32.51 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  26.74 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1364  hypothetical protein  28.74 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  32.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  32.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  28.19 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  25.84 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  30.26 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  32.65 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  35.59 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  25.42 
 
 		 471 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  27.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  28.82 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  30.62 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  26.7 
 
 		 410 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.45 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  26.04 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  24.79 
 
 		 423 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  31.28 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  31.11 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  26.29 
 
 		 226 aa  42  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.67 
 
 		 608 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>