84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0400 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0576  hypothetical protein  66.32 
 
 
279 aa  328  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0856861  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  44.6 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  48.83 
 
 
268 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  46.24 
 
 
257 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1727  hypothetical protein  48.86 
 
 
299 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.029658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  29.34 
 
 
249 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  28.08 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  27.53 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  27.53 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  27.53 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  27.13 
 
 
230 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  27.13 
 
 
230 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  27.64 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  29.1 
 
 
499 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  28.95 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  28.68 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  28.24 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  27.45 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  27.45 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  27.07 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  27.06 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  27.44 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  27.1 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  26.27 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  27.82 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  23.68 
 
 
232 aa  67  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  25.37 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  25.94 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  27.24 
 
 
393 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  26.47 
 
 
211 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  26.98 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  28.9 
 
 
230 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  26.09 
 
 
224 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  27.78 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  25.5 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  25.94 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  25.69 
 
 
220 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  26.45 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  26.22 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  27.45 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  25.78 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  26.69 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  25.11 
 
 
471 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  26.75 
 
 
224 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  25.59 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  27.17 
 
 
423 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  27.27 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  31.36 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  31.36 
 
 
227 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  26.42 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  28.97 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  23.02 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  28.08 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  24.68 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  25.49 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  24.9 
 
 
224 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  20.93 
 
 
221 aa  49.3  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  29.37 
 
 
219 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  20.69 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  26.79 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  28.94 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  24.8 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  24.4 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  24.05 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  31.21 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  24.9 
 
 
247 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  25.39 
 
 
344 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  34.78 
 
 
249 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  32.99 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  29.55 
 
 
220 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  26.79 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  26.27 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  23.92 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  27.02 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  32.3 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  27.57 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  30.38 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  22.62 
 
 
219 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  25.22 
 
 
251 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>