41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0597 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  39.55 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  44.85 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  44.85 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  35.03 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  37.9 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  38.71 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  30.73 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  32.95 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  32.95 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  28.9 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  30.67 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  33.12 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  39.09 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  31.79 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  35.16 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  31.9 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  32.58 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  31.06 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  33.61 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  31.5 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  30.43 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  27.17 
 
 		 172 aa  62  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  33.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  32 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  31.2 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  36.36 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  29.63 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  30.94 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  30.88 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  30.88 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  31.53 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  31.53 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  27.97 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  29.2 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  27.64 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  28.81 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  31.47 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  34.57 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  29.63 
 
 		 91 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>