191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3031 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  91.85 
 
 		 140 aa  261  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.78 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  38.52 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  38.17 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.98 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  37.12 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  31.85 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  34.56 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.83 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  33.82 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  37.01 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.85 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  37.04 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.33 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  37.21 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.52 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  29.93 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  34.85 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  30.37 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 689 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  35.16 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  34.88 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  32.31 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  30.3 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  35.11 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.59 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  34.11 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.91 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 		 360 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  30.47 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  30.6 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 518 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  33.61 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.07 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 559 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  30.88 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  32.84 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 927 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 518 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  35.34 
 
 		 722 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  31.25 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 963 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 779 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  23.66 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  29.85 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  29.77 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  30.47 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 941 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 722 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  31.65 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 1032 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  33.33 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 		 871 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 963 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 529 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 926 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  31.71 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 579 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 526 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  28.1 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 498 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  29.1 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>