More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0072 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  100 
 
 
324 aa  658  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  94.44 
 
 
324 aa  627  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  9.5367e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  30.33 
 
 
304 aa  116  4e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
305 aa  111  2e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
297 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  30.03 
 
 
290 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 
283 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  28.62 
 
 
281 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  28.9 
 
 
307 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35994e-11 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  27.67 
 
 
305 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 
281 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  28.91 
 
 
304 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  31.14 
 
 
286 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
298 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
298 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  28.18 
 
 
298 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.45 
 
 
281 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  30.55 
 
 
303 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  31.34 
 
 
327 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  28.19 
 
 
312 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 
301 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  29.07 
 
 
276 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
297 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 
288 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  28.67 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  28.33 
 
 
293 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  28.33 
 
 
293 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  27.46 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  29.6 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  27.67 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  27.53 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.37 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.37 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  28.12 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.99 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  28.87 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  27.12 
 
 
285 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  29.53 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  29.41 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 
277 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.98 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  27.06 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  25.32 
 
 
296 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  29.48 
 
 
284 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 
285 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.86 
 
 
289 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  27.7 
 
 
270 aa  92.4  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.62 
 
 
277 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  26.76 
 
 
297 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  28.33 
 
 
279 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 
289 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  28.63 
 
 
277 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.74 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  28.41 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  28.03 
 
 
279 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  28.33 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  27.89 
 
 
477 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  29.72 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  30 
 
 
430 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  29.08 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  26.85 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.69 
 
 
281 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.69 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  28.69 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.69 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.69 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  28.69 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  26.37 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.22 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  28.82 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  29.36 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28 
 
 
284 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  29.58 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  25.63 
 
 
273 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  27 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.68 
 
 
276 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.2 
 
 
281 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  28.16 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  27.53 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  27.72 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 
389 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.32868e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  29.13 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.29 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  27.73 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  31.27 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>