30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_1507 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS1396  lysM domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000873032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1507  lysm domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  99.37 
 
 		 159 aa  316  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  96.86 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  88.68 
 
 		 159 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  88.68 
 
 		 159 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  88.68 
 
 		 159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  86.79 
 
 		 159 aa  253  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1369  peptidoglycan-binding protein  90.57 
 
 		 162 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6403400000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1581  lysM domain protein  90.57 
 
 		 159 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05729e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  59.88 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0438  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.31 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  47.92 
 
 		 451 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 849 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.74 
 
 		 471 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.54 
 
 		 334 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.55 
 
 		 576 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  46.94 
 
 		 583 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44.68 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  43.55 
 
 		 650 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 597 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2095  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.69 
 
 		 335 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  34.38 
 
 		 471 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.44 
 
 		 679 aa  40.8  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 		 474 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  37.7 
 
 		 485 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>