More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5508 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  70.72 
 
 		 785 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  72.8 
 
 		 798 aa  1114    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  61.1 
 
 		 854 aa  966    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 835 aa  1605    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  60.27 
 
 		 775 aa  872    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  59.15 
 
 		 783 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  49.04 
 
 		 812 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  46 
 
 		 821 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  61.73 
 
 		 780 aa  912    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  59.15 
 
 		 783 aa  868    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  61.33 
 
 		 804 aa  928    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.29 
 
 		 823 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  65.04 
 
 		 778 aa  960    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  60 
 
 		 769 aa  895    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  59.15 
 
 		 783 aa  868    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  72.26 
 
 		 789 aa  1107    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  59.42 
 
 		 776 aa  886    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  53.94 
 
 		 760 aa  765    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.68 
 
 		 778 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 793 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 840 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.02 
 
 		 773 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  43.9 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.9 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.02 
 
 		 776 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  43.9 
 
 		 773 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.02 
 
 		 776 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  41.96 
 
 		 817 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 		 797 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  43.66 
 
 		 776 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 805 aa  625  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  43.9 
 
 		 776 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  43.9 
 
 		 776 aa  625  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 797 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 880 aa  622  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.82 
 
 		 815 aa  618  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 810 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  43.29 
 
 		 773 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  45.04 
 
 		 793 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.13 
 
 		 817 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.29 
 
 		 773 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 		 819 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.09 
 
 		 806 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  40.93 
 
 		 792 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 774 aa  612  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 775 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.79 
 
 		 768 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 		 813 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 828 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 856 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  41.7 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  41.96 
 
 		 816 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  41.73 
 
 		 798 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  42.14 
 
 		 812 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  42.48 
 
 		 804 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  42.74 
 
 		 775 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.84 
 
 		 817 aa  602  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  41.87 
 
 		 783 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.67 
 
 		 786 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  42.48 
 
 		 804 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  41.67 
 
 		 817 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  42.65 
 
 		 815 aa  598  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.97 
 
 		 784 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 772 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  53.92 
 
 		 798 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 787 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  42.42 
 
 		 806 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 784 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 		 801 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.03 
 
 		 811 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 825 aa  594  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  43.55 
 
 		 843 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  43.43 
 
 		 797 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 835 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  41.67 
 
 		 781 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 		 772 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 784 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  42.67 
 
 		 785 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.65 
 
 		 804 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  45.41 
 
 		 803 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 835 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 785 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  41.48 
 
 		 816 aa  592  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  41.84 
 
 		 816 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  42.28 
 
 		 785 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  41.45 
 
 		 787 aa  591  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 		 796 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 783 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.02 
 
 		 799 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  41.13 
 
 		 823 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  41.04 
 
 		 783 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>