112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  62.44 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  58.97 
 
 
206 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  53.33 
 
 
212 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.73 
 
 
215 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.05 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  43.3 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.24 
 
 
209 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  38.5 
 
 
208 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.25 
 
 
210 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.32 
 
 
223 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  37.24 
 
 
190 aa  99  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.98 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.76 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.89 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  50 
 
 
132 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  35.23 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.96 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.9 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.04 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.68 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  31.61 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.61 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.45 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.43 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.61 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.89 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.53 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.12 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.6 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.1 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  32.3 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  34.3 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  29.49 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  34.38 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.73 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.08 
 
 
198 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.26 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1100  putative reductase  66.67 
 
 
67 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0134803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.16 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.12 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.53 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.98 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.19 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  29.29 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  30.46 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.19 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.34 
 
 
257 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  28.64 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  28.43 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.14 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  27.85 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  27.23 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  27.1 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.61 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.93 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.47 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  29.12 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.76 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.04 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  31.37 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.85 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  27.37 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.07 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.5 
 
 
197 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.17 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.87 
 
 
251 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.8 
 
 
286 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.84 
 
 
259 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.85 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  30 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  31.69 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  28.35 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.91 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  24.38 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.57 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.1 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.06 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.56 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.75 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  31.25 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  37.35 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.03 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.47 
 
 
223 aa  45.1  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.77 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.66 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.91 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1707  dehydrogenase  36.56 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  25 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>