56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2428 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  49.08 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  43.8 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  41.39 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  40.73 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  39.68 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  38.43 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  40.36 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  39.93 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  37.32 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  41.76 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  37.37 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  37.37 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  37.37 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  39.71 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  38.2 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  38.99 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  40 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  37.59 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  33.21 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  36.88 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  37.08 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  36.19 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  39.57 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  35.23 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  35.46 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  36.86 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  35.04 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  28.83 
 
 		 306 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  32.79 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  25.48 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  25.48 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  25.48 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  25.48 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  25.48 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  25.48 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  28.29 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  25.87 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  25.87 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  25.87 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  25.1 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  25.76 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  23.62 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  29.41 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  24.22 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  27.13 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  28.52 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  29.81 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  25.52 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  20.65 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  20.65 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  27.51 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  31.46 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  27.05 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  30.71 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  29.63 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>