More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0139 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  350  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  75.98 
 
 
165 aa  243  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0050  FHA domain-containing protein  55.75 
 
 
156 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00259691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  52 
 
 
155 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  52.05 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0023  FHA domain-containing protein  54.02 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  51.46 
 
 
161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  49.13 
 
 
159 aa  160  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  49.16 
 
 
168 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  50.29 
 
 
156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  50.88 
 
 
154 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  50.57 
 
 
166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0034  FHA domain containing protein  48.55 
 
 
175 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  50.28 
 
 
169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0025  FHA domain-containing protein  45.81 
 
 
160 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0028  FHA domain-containing protein  51.18 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0807  FHA domain-containing protein  50.3 
 
 
168 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10019  hypothetical protein  45.56 
 
 
155 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0341337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0020  FHA domain-containing protein  48.24 
 
 
154 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  46.5 
 
 
152 aa  136  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0028  FHA domain-containing protein  48.24 
 
 
154 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377029  hitchhiker  0.00774619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  48.24 
 
 
154 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  50.29 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  41.95 
 
 
158 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  47.67 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  47.02 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  44.03 
 
 
160 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  54.39 
 
 
160 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0030  Forkhead-associated protein  55.26 
 
 
153 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  66.67 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  44 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  41.76 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  56.56 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  39.55 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  42.02 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  45 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  36.52 
 
 
178 aa  112  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  32.24 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  46.23 
 
 
155 aa  82  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  41.07 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  32.76 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  37.08 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  39.51 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  30.81 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  43.37 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  39.42 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  39.77 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  45.36 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.51 
 
 
557 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  31.47 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  35.48 
 
 
122 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  39.29 
 
 
122 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  36 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0909  FHA domain-containing protein  45 
 
 
120 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  35.48 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
310 aa  61.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  31.48 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  41.76 
 
 
146 aa  60.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  34.09 
 
 
694 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.5 
 
 
554 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 
554 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
395 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  33.03 
 
 
294 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  35.87 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  40.85 
 
 
269 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  34.02 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  41.1 
 
 
320 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  24.14 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  30.65 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  34.86 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
142 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  37.78 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1075  FHA domain-containing protein  38.96 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
1065 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  37.86 
 
 
252 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  31.82 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  43.06 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  34.65 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  35.38 
 
 
566 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.07 
 
 
903 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  29.81 
 
 
146 aa  58.2  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.46 
 
 
1004 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  36.14 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  38.03 
 
 
308 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  40 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  39.24 
 
 
546 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  41.3 
 
 
121 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  34.44 
 
 
279 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  38.3 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  41.94 
 
 
121 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  38.04 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>