More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4386 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4386  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 452 aa  883    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0188  protein serine/threonine phosphatase  70.12 
 
 		 560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  31.95 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 256 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33.47 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 		 256 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 		 256 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.79 
 
 		 241 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.87 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.64 
 
 		 256 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  32.05 
 
 		 419 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.63 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  30.52 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  30.89 
 
 		 463 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  32.2 
 
 		 254 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  29.22 
 
 		 571 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  33.86 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  31.17 
 
 		 241 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  30.49 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.47 
 
 		 237 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 271 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.83 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  26.59 
 
 		 245 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.61 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3435  protein serine/threonine phosphatases  29.92 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  28.4 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.27 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  29.67 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  30.21 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  28.89 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  30.33 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.62 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  26.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  27.62 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  29.67 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  30.28 
 
 		 280 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  25.67 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  30.34 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  24.58 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  28.26 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  28.97 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  29.18 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.31 
 
 		 611 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3499  PASTA domain-containing protein  33.33 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.91 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  29.51 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2128  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 		 691 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.66852  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.51 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.43 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.87 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  25.38 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  34.67 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  29.67 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  29.48 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4570  protein serine/threonine phosphatase  27.21 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  29.67 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.19 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  25.52 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  28.1 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  28.16 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2449  protein serine/threonine phosphatase  30.32 
 
 		 239 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  23.76 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  28.52 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  33.17 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  29.63 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  29.39 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  31 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  32.11 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  29.13 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.13 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.13 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  27.45 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  29.84 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.12 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  28.88 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  27.59 
 
 		 591 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  27.31 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>