More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0188 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0188  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
560 aa  1085    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4386  protein serine/threonine phosphatases  70.12 
 
 
452 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  33.07 
 
 
256 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 
395 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  31.35 
 
 
325 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
323 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33.88 
 
 
452 aa  100  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
472 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
256 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 
321 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
256 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
256 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.6 
 
 
421 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.13 
 
 
241 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
519 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
271 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
252 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.47 
 
 
237 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.93 
 
 
236 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  30.45 
 
 
571 aa  94.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  31.42 
 
 
419 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  31.02 
 
 
426 aa  94  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  32.94 
 
 
241 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  32.79 
 
 
265 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.3 
 
 
386 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 
469 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.83 
 
 
425 aa  90.5  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.04 
 
 
417 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
254 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.25 
 
 
394 aa  88.6  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  26.25 
 
 
236 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  29.67 
 
 
466 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 
467 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  29.15 
 
 
505 aa  87.4  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.61 
 
 
247 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  29.04 
 
 
280 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  26.44 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  29.67 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  33.2 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  30.21 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  31.23 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  25.67 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.29 
 
 
482 aa  84  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  29.34 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28.16 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1366  protein serine/threonine phosphatase  30.16 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  28.03 
 
 
238 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3435  protein serine/threonine phosphatases  28.91 
 
 
281 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  25.4 
 
 
245 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  29.44 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  26.56 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.54 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 
259 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  28.24 
 
 
267 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
259 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  25.29 
 
 
249 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  25.52 
 
 
236 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  30.27 
 
 
276 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  29.15 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  30.77 
 
 
348 aa  77  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  29.12 
 
 
244 aa  77  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  26.51 
 
 
482 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.74 
 
 
611 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.29 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  27.6 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  31.05 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  25.72 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  30.12 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  32.54 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  26.92 
 
 
241 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  30.21 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  30.9 
 
 
381 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  27.94 
 
 
245 aa  73.2  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  29.33 
 
 
236 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  26.29 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.83 
 
 
238 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  28.71 
 
 
595 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  29.08 
 
 
239 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  26.46 
 
 
252 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  30.43 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  28.3 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  27.94 
 
 
255 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  24.79 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3865  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.49 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  28.41 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.24 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  28.41 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3143  protein serine/threonine phosphatases  27.07 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000847096  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>