19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1737 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  81.88 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  33.9 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  44.36 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  33.72 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  36.77 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  34.03 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  39.07 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  30.92 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  35.88 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  32.65 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  34.88 
 
 		 277 aa  62  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  35.93 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  36.41 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  34.2 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  35.87 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  35.85 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  36.26 
 
 		 442 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  34.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>