More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1576 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  71.97 
 
 		 329 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  64.4 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  47.57 
 
 		 714 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  45.64 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.19 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.81 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.45 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 705 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.69 
 
 		 652 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 387 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  34.75 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 333 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 340 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 1152 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 691 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  37.02 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 691 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 691 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 401 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 683 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  33 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.36 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 785 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 1106 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  31.09 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 346 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>