26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0052 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  100 
 
 
1142 aa  2206  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  54.07 
 
 
1101 aa  704  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  34.01 
 
 
1031 aa  317  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  36.62 
 
 
954 aa  213  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  34.7 
 
 
978 aa  182  3e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  33.57 
 
 
1320 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  29.06 
 
 
1153 aa  150  2e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  32.85 
 
 
1383 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  23.13 
 
 
1056 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  31.73 
 
 
818 aa  108  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.59 
 
 
818 aa  97.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  26.37 
 
 
1171 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  24.87 
 
 
1107 aa  90.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  25.78 
 
 
1137 aa  84.3  1e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  29.33 
 
 
926 aa  83.2  3e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  27.89 
 
 
816 aa  79.7  3e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  25.13 
 
 
830 aa  70.9  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  27.78 
 
 
828 aa  69.7  3e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  37.5 
 
 
774 aa  65.1  7e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  33.77 
 
 
773 aa  64.7  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  33.85 
 
 
818 aa  61.2  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  36.04 
 
 
770 aa  55.1  8e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  32.31 
 
 
825 aa  54.7  9e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  50 
 
 
384 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  57.14 
 
 
349 aa  46.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  56.76 
 
 
775 aa  44.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>