More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1155 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  309  9e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  68.42 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  63.4 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 156 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  44.52 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  43.05 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  41.89 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  44.09 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  39.1 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>