More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3615 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  318  2e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.43014e-05  normal  0.24531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.74781e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.19579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.10908e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.10708e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.61642e-05  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  93.04 
 
 
158 aa  303  5e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.58072e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.7905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  87.34 
 
 
158 aa  286  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  86.79 
 
 
159 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  84.81 
 
 
158 aa  277  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  84.18 
 
 
158 aa  276  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  84.18 
 
 
158 aa  276  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  84.18 
 
 
158 aa  276  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.72965e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  82.91 
 
 
158 aa  274  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  81.01 
 
 
158 aa  269  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  77.71 
 
 
158 aa  258  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  73.42 
 
 
158 aa  245  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  71.52 
 
 
158 aa  244  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  73.86 
 
 
153 aa  237  6e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  70.89 
 
 
158 aa  232  1e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  9.61411e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  69.62 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.41028e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  69.62 
 
 
158 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 
158 aa  228  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 
158 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 
158 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  70.89 
 
 
158 aa  228  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
159 aa  225  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  68.35 
 
 
158 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  68.35 
 
 
158 aa  223  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  67.09 
 
 
158 aa  221  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.96364e-05  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  66.01 
 
 
153 aa  217  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  67.97 
 
 
153 aa  217  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.15218e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  64.56 
 
 
158 aa  216  8e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  67.53 
 
 
160 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 
158 aa  215  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  65.19 
 
 
158 aa  213  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  65.19 
 
 
158 aa  213  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  212  2e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.49804e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  209  8e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  66.45 
 
 
159 aa  209  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 
159 aa  208  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  63.29 
 
 
158 aa  207  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 
157 aa  207  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  63.23 
 
 
173 aa  207  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  63.23 
 
 
159 aa  207  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
158 aa  207  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  4.26484e-12  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 
158 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 
160 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 
160 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 
158 aa  204  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 
158 aa  205  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 
158 aa  204  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  64.56 
 
 
157 aa  203  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 
158 aa  203  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  3.15443e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  59.74 
 
 
158 aa  199  8e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  62.99 
 
 
158 aa  199  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  58.23 
 
 
158 aa  199  1e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  59.09 
 
 
158 aa  196  8e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0589  transcription elongation factor GreA  63.92 
 
 
157 aa  196  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 
158 aa  194  5e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0163  transcription elongation factor GreA  65.19 
 
 
158 aa  193  8e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.28888e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 
158 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.33551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 
154 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4588  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 
160 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4723  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 
160 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4722  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 
160 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0710  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 
160 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0264242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  184  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
171 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  182  1e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  183  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
176 aa  183  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  182  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  181  2e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 
172 aa  182  2e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.69 
 
 
158 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
173 aa  180  5e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>