More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0776 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 
226 aa  265  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 
226 aa  240  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 
223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 
231 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
223 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 
236 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
223 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
223 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
222 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  43.05 
 
 
221 aa  174  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  43.58 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  43.69 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  43.18 
 
 
223 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
224 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
225 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 
229 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  43.18 
 
 
224 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  41.74 
 
 
224 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 
229 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
227 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 
220 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
226 aa  167  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
219 aa  167  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
217 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40 
 
 
224 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
230 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.6 
 
 
223 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
226 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 
260 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
227 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
257 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
266 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  40 
 
 
224 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  43.12 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
229 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 
225 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
253 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
247 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
225 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 
227 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  42.01 
 
 
227 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  39.29 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.64 
 
 
218 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 
226 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 
222 aa  161  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  41.86 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
242 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
221 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 
232 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.79 
 
 
225 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
273 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
223 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
221 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 
232 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  40 
 
 
221 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
229 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
223 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  38.12 
 
 
232 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.88 
 
 
222 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
223 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
223 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 
226 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  38.12 
 
 
223 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>