196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0138 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  63.45 
 
 
202 aa  265  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  62.94 
 
 
202 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  61.42 
 
 
202 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  65.54 
 
 
200 aa  235  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  41.95 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  38.73 
 
 
172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  38.86 
 
 
165 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  35.59 
 
 
166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  36.78 
 
 
164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  37.79 
 
 
158 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  37.93 
 
 
164 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  39.2 
 
 
165 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  36.72 
 
 
165 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  34.97 
 
 
185 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  36.16 
 
 
165 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  35.91 
 
 
183 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  35.63 
 
 
164 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  36 
 
 
165 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  35.91 
 
 
183 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  35.36 
 
 
183 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  38.6 
 
 
167 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  35.63 
 
 
166 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  35.06 
 
 
215 aa  102  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  39.41 
 
 
166 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  38.37 
 
 
163 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  37.02 
 
 
165 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  35.33 
 
 
168 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  40.24 
 
 
228 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  38.69 
 
 
167 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  37.36 
 
 
168 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  34.86 
 
 
168 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  35.16 
 
 
215 aa  99.8  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  36.93 
 
 
166 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  38.69 
 
 
166 aa  99  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  36.87 
 
 
166 aa  98.6  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  32.77 
 
 
182 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  35.03 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  37.36 
 
 
173 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  35.43 
 
 
166 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  33.33 
 
 
191 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  34.86 
 
 
166 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  36.26 
 
 
168 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  34.09 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  34.29 
 
 
166 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  36.31 
 
 
166 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  34.86 
 
 
166 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  34.48 
 
 
166 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  34.86 
 
 
166 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  32.2 
 
 
182 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  34.95 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  34.64 
 
 
184 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  33.14 
 
 
166 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  33.71 
 
 
165 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  35.47 
 
 
168 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  34.22 
 
 
190 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  36.36 
 
 
165 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  33.33 
 
 
191 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  35.8 
 
 
166 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  34.46 
 
 
190 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  32.26 
 
 
191 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  31.07 
 
 
185 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  34.13 
 
 
166 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  34.46 
 
 
166 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  34.09 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  34.46 
 
 
190 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  32.09 
 
 
191 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  32.77 
 
 
191 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  34.46 
 
 
191 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  36.46 
 
 
190 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  34.86 
 
 
168 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  31.55 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  32.07 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  31.64 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  33.15 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  32.2 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  32.29 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  31.82 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  32.2 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  30.6 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  35.03 
 
 
696 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  32 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  32.43 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  30 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  32.6 
 
 
202 aa  82  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  34.71 
 
 
696 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  32.2 
 
 
190 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  34.46 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  31.64 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  33.33 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  31.07 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  33.9 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  30.17 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  30.17 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  33.9 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  29.15 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  27.12 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  30.89 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  35.59 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  32.45 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>