242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0067 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  1.85241e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  576  1e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  99.65 
 
 
287 aa  575  1e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  99.65 
 
 
287 aa  574  1e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  572  1e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  572  1e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  96.17 
 
 
287 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  1.038e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  96.52 
 
 
287 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  96.17 
 
 
287 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  96.52 
 
 
287 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  96.52 
 
 
287 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  91.29 
 
 
287 aa  538  1e-152  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  87.8 
 
 
287 aa  515  1e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  87.8 
 
 
287 aa  515  1e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  87.46 
 
 
287 aa  514  1e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  86.76 
 
 
287 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  4.05788e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  85.37 
 
 
287 aa  504  1e-142  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  86.76 
 
 
287 aa  504  1e-142  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  85.37 
 
 
287 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  83.28 
 
 
287 aa  493  1e-138  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  68.06 
 
 
288 aa  407  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  66.2 
 
 
287 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  67.71 
 
 
288 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  66.55 
 
 
287 aa  400  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  65.28 
 
 
288 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  62.37 
 
 
290 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  63.41 
 
 
287 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  63.76 
 
 
287 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  62.72 
 
 
287 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  62.02 
 
 
287 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  6.23436e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  62.02 
 
 
287 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  62.02 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  62.02 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  62.02 
 
 
287 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  62.37 
 
 
287 aa  368  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  61.67 
 
 
309 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  61.67 
 
 
287 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  61.67 
 
 
287 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  61.67 
 
 
287 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.59441e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  60.63 
 
 
287 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  64.83 
 
 
288 aa  366  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  61.67 
 
 
287 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  61.67 
 
 
287 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  60.63 
 
 
287 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  63.41 
 
 
287 aa  362  5e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  2.02204e-08 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  56.1 
 
 
287 aa  348  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  49.83 
 
 
288 aa  278  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  48.26 
 
 
288 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  50.35 
 
 
287 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  49.13 
 
 
288 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  49.31 
 
 
287 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  7.31437e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  48.8 
 
 
288 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  48.61 
 
 
288 aa  268  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  50.35 
 
 
287 aa  268  6e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  48.61 
 
 
287 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  49.32 
 
 
289 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  47.95 
 
 
287 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  47.95 
 
 
287 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  1.31074e-06 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  48.61 
 
 
287 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  48.08 
 
 
287 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  47.92 
 
 
287 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  47.92 
 
 
287 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  48.26 
 
 
287 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  46.88 
 
 
287 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  44.6 
 
 
287 aa  252  5e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  46.53 
 
 
287 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  44.6 
 
 
300 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  44.25 
 
 
300 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  44.6 
 
 
287 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  47.57 
 
 
286 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  44.83 
 
 
289 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  45.58 
 
 
282 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  44.75 
 
 
293 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  42.01 
 
 
287 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.29302e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  40.28 
 
 
288 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  40.28 
 
 
288 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  42.71 
 
 
288 aa  222  5e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  45.52 
 
 
288 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  41.11 
 
 
297 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  41.32 
 
 
288 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  38.59 
 
 
311 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  38.54 
 
 
311 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  40.48 
 
 
288 aa  200  2e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  37.62 
 
 
311 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  37.5 
 
 
311 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  36.98 
 
 
311 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  37.46 
 
 
315 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  36.81 
 
 
336 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  184  1e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  36.48 
 
 
319 aa  182  5e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  36.16 
 
 
327 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  36.16 
 
 
327 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  36.48 
 
 
307 aa  182  8e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  182  8e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>