More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1354 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  76.6 
 
 		 467 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  100 
 
 		 456 aa  913    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  71.8 
 
 		 542 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  74.64 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  59.34 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  36.19 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  39.42 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.78 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.71 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.45 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.84 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.84 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  36.22 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  35.25 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  33.65 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  34.57 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  38.28 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.89 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  37.88 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  34.52 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.58 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  36.58 
 
 		 469 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.12 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  34.2 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  34.36 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  32.85 
 
 		 480 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  34.67 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  34.36 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.17 
 
 		 465 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  34.43 
 
 		 468 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  33.33 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  34.43 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  33.33 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  32.61 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  32.61 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.87 
 
 		 473 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  33.09 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  34.52 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.71 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  32.37 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.92 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  32.69 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.9 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  34.06 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  31.65 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  34.05 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  34.76 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.18 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 446 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  31.52 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  31.52 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.83 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  30.72 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.97 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  35.07 
 
 		 462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  33.09 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  36.49 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  33.89 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  32.61 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.53 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.44 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  31.8 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  33.33 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  34.36 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  34.36 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  33.01 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  33.41 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  32.15 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  31.75 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  35.65 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.05 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  33.95 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  37.5 
 
 		 473 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.17 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  32.37 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.3 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.17 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  33.09 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.33 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.93 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.93 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  31.32 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  36 
 
 		 486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  33.49 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31.33 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  31.08 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31.33 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.17 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31.33 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  32 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  32.86 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  33.18 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.26 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  33.25 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  36.63 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  32.4 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.33 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.26 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.26 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>