More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0081 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
96 aa  190  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  79.17 
 
 
96 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  76.04 
 
 
96 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.4312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 
96 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  3.19643e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 
96 aa  117  4e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  63.54 
 
 
96 aa  113  8e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  9.93724e-13  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  52.08 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  55.43 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0278  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  3.01066e-11  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2630  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  2.25404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3066  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.81446e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3480  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  3.57625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3744  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.0751e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1926  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  5.97608e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3774  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  5.18594e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3167  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.45787e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0350  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  1.62065e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2757  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  3.00049e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3449  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  2.44074e-12  normal  0.012759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3802  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00374922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0269  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000217193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0329  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  1.04942e-07  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0251  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  82  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.96316e-07  normal  0.0882759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  7.53496e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  4.0814e-10  hitchhiker  2.23362e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.57307e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 
104 aa  81.3  4e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.38806e-07  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 
94 aa  81.3  4e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3017  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  80.1  8e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  8.78321e-07  decreased coverage  0.0020306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
98 aa  80.5  8e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.10962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
97 aa  79.7  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3642  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  79.3  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.01067e-08  hitchhiker  1.69859e-11 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0316  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  79.3  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.11744e-08  decreased coverage  0.00276856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
94 aa  78.6  3e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.16587e-06  hitchhiker  9.56309e-13 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0052  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
104 aa  77.4  5e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.36053e-14  hitchhiker  3.59649e-24 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0055  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 
104 aa  77.4  6e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.33404e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
96 aa  77.4  7e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
97 aa  76.3  1e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0407  50S ribosomal protein L23P  48.35 
 
 
101 aa  76.6  1e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.8308e-08  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.23 
 
 
109 aa  75.5  2e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
98 aa  75.5  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
95 aa  75.5  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.2639e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  45 
 
 
99 aa  75.1  3e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
94 aa  75.1  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0321  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
100 aa  74.7  4e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.11411e-18  hitchhiker  6.47477e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
101 aa  74.3  5e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  1.12822e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  46.59 
 
 
98 aa  74.3  5e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.30523e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
103 aa  73.9  6e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1266  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
104 aa  73.9  7e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  3.10284e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  46.07 
 
 
98 aa  73.9  8e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  6.00083e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
94 aa  72.4  2e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
94 aa  72  2e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
94 aa  72.4  2e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.34151e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3793  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
108 aa  72.4  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0844484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 
103 aa  72.8  2e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3997  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
108 aa  71.6  3e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37329e-06 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
95 aa  71.6  3e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.48 
 
 
94 aa  71.6  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
94 aa  71.2  5e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
97 aa  70.9  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
104 aa  70.9  6e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  8.42978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
95 aa  70.9  6e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
98 aa  70.9  6e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.34931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
104 aa  70.5  7e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 
95 aa  70.5  8e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  45.65 
 
 
97 aa  70.5  8e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
100 aa  70.1  8e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  4.09295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
100 aa  70.1  8e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.1109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
111 aa  70.5  8e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  7.71327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
102 aa  70.1  9e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  9.26616e-10  hitchhiker  1.49946e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
94 aa  70.1  9e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
101 aa  70.1  9e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
96 aa  70.1  9e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
97 aa  69.7  1e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  47.25 
 
 
100 aa  69.7  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
100 aa  69.7  1e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  41.49 
 
 
100 aa  69.3  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0769  ribosomal L23 protein  43.01 
 
 
111 aa  69.7  1e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.187715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  3.36824e-09 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
97 aa  69.7  1e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.05028e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0258  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000322493  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 
97 aa  69.3  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
98 aa  69.3  2e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 
99 aa  69.3  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
98 aa  69.3  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0205  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 
94 aa  68.9  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.47106e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
103 aa  68.9  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  6.27291e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
100 aa  68.6  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
100 aa  68.6  3e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
100 aa  68.6  3e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
100 aa  68.6  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 
97 aa  68.6  3e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 
97 aa  68.2  4e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>